MİKROBİYOLOJİ
Mikroorganizma,Mikroskopla görülebilen basit ve tek hücreli canlılara denir. Bu terim ?çok küçük
canlı? anlamındaki Yunanca sözcüklerden türetilmiştir. Mikroorganizma olarak isimlendirilen canlılar, gelişmişcanlılardan daha önce yeryüzüne yayılmışlarsa da çok küçük olmalarınedeni ile bunların doğrudan
izlenip, incelenebilmeleri için mikroskop ve mikroskoplama tekniklerinin gelişmesini beklemek gerekmiştir.
Mikrobiyoloji ve Bilim Dalları
Mikrobiyoloji bileşik bir sözcük olup, Yunanca mikro, biyo ve loji sözcüklerinin
birleşmesiyle oluşmuştur. Bu sözcüklerden mikro gözle görülemeyecek kadar küçük, biyo
canlı, loji de bilim anlamına gelir. Sözlük anlamı, gözle görülmeyecek kadar küçük canlı
bilimi olmaktadır.
Mikrobiyoloji doğal bilimler arasında genç bir bilim dalıolmasına rağmen, kısa
zamanda her yönüyle büyük gelişmeler göstermiştir. Bu hızlıgelişmenin sonucu olarak
günümüzde çok farklıuğraşalanlarına yönelik, farklıad ve kapsamda mikrobiyoloji dalları
ortaya çıkmıştır.
Mikroorganizma grubu içinde yer alan ve farklıözelliklere sahip canlılarıinceleyen,
· Bakteriyoloji, bakterilerin incelendiği uzmanlık alanı,
· Mikoloji, maya ve küflerin birlikte incelendiği uzmanlık alanı,
· Viroloji, virüsleri inceleyen uzmanlık alanıgibi çalışma alanlarıortaya çıkmıştır.
Farklıuzmanlık alanlarına göre ise;
· Tıbbi mikrobiyoloji: Mikroorganizmaların insanlarla ilişkisi ve insanlara verdiği zararlarıaraştırır,
· Gıda mikrobiyolojisi: Gıda üretim teknolojisinde mikroorganizmaların zararlı
etkilerini engellemek ve yararlıetkilerinden faydalanarak gıda üretiminde
kullanmayıamaçlar,
· Teknik ve endüstriyel mikrobiyoloji: Mikroorganizmalarıkullanarak değişik
besin maddelerinin üretimi, üretiminde kullanılan kültür yöntemleri (peynir,
yoğurt mayasıgibi) ve teknikleri, üretimde yeni yöntem ve tekniklerin
geliştirilmesi, mikroorganizmaların zararlıetkilerinden korumada yararlanılacak
uygulamalar, atıkların değerlendirilmesi, su ve atık arıtma işlemlerini kapsar
Mikroorganizmaların Canlılardaki Yeri ve Genel Özellikleri
Doğada çok yaygın olarak bulunan ve canlılar alemini oluşturan varlıklar, yapılarıve
diğer özellikleri dikkate alınarak gruplara ayrılmıştır.
Canlıların tümü üç büyük grupta toplanır;
· Bitkiler
· Hayvanlar
· Protistalar (mikroorganizmalar)
Bilim adamlarımikroorganizmaların beslenme, hareket ve hücre yapılarıyanında,
metabolik faaliyetlerindeki farklılıklar nedeniyle protista (Yunanca ilkel hayvan) alemi
olarak ayrıbir sınıflandırmayıuygun bulmuşlardır.
Mikroorganizmalar protista aleminin üyeleridir. Protistalar kendi aralarında gelişmiş
ve ilkel çekirdekli ökaryotlar ve prokaryotlar olarak ikiye ayırmışlardır.
Bu ayrımda hücre yapısıesas alınmışolup, gelişmişprotista olarak sınıflanan
mikroorganizmalar hücre yapılarıbakımından hayvan ve bitkilere benzer; ökaryotik
canlılardır. Küf mantarları, mayalar bu mikroorganizmalara örnektir. Belirli bir çekirdek
zarıile çevrili, gerçek bir çekirdek içermeyen mikroorganizmalar ise ilkel protistaları
oluşturur ve bunlar da prokaryotlar yani ilkel çekirdekliler olarak tanımlanır. Bakteriler bu
gruba girer.
Mikroorganizmaları Sınıflandırma
Mikroorganizmaların isimlendirilmelerinde Linnaeus tarafından geliştirilen sistem
kullanılır. Bilim dili olarak Latince kullanılmıştır. Mikroorganizmalar ; alem, bölüm, sınıf,
takım, familya, cins ve tür gibi sıralamayla sınıflandırılır.
Sınıflandırmanın temeli;
Alem: Birbiri ile ilgili bölüm grubunu gösterir.
Bölüm: Birbiri ile ilgili sınıf grubunu gösterir.
Sınıf: Birbiri ile ilgili takım grubunu gösterir (tes ile biter = Zygomycetes) .
Takım: Birbiri ile ilgili familya grubunu gösterir (ales ile biter = Eubacteriales) .
Familya: Birbiri ile ilgili cins grubunu gösterir (aceae ile biter = Lactobacillaceae) .
Cins: Birbiri ile ilgili tür grubunu gösterir.
Tür: Tek bir canlıyıgösterir.
Alt tür: varyetedir (var olarak yazılır).
Bakteriler
Hücre Yapıları
Prokaryotik özellik gösteren bakteriler, doğada toprak, su, hava, bitki, hayvan gibi her
yerde bulunabilmektedir.
Bakterilerin büyük çoğunluğu tek hücrelidir. Besinsel gereksinimleri basittir ve
çevresel koşullara hızlıuyum yeteneğindedir.
Bakterilerde hücre yapısıdıştan içe doğru hücre duvarı, stoplazma zarıve
stoplazmadan oluşur .Belirli bir zarla çevrili gerçek çekirdekleri yoktur.
Stoplazmanın herhangi bir yerinde yoğunlaşmışçekirdek materyali bulunur. Bir bakteri
hücresinin %75-80?i su, %15-30?u kuru maddeden oluşur. Kuru maddenin %50?si protein,
%20?si hücre duvarı, %10?u yağ, %10-20?si RNA ve %3-4?ü DNA?dır.
Bakteriyel ana yapılar; kapsül, hücre duvarı, flagella ve pililer, stoplazma membranı
ve membran sistemleri, endospor, gaz vesikülleri, klorobium vesikülleri, karboksizomlar,
depo besin maddeleri, ribozomlar ve bakteriyel kromozom olarak tanımlayabiliriz.
· Hücre duvarı: Stoplazmanın etrafınısaran zayıf olan iç kısımlarıve organelleri
dışetkilerden koruyan ince, yarıkatıve kuvvetli bir tabakadır. Hücrenin
karakteristik şeklinden sorumlu olan bu tabaka yarıgeçirgen bir yapıdadır. Bu
yapıortamdaki gıda maddelerinin hücre içine geçmesinde metabolizma
atıklarının da dışarıatılmasında rol oynar.
Hücre duvarı, bakteriler için özel önemi olan gram-boyamada etkilidir. Gram
boyamada kristal viyole ile boyanan ve mor renk görünen bakteriler gram pozitif,
safraninle boyanan pembe renk veren bakteriler ise gram negatif olarak sınıflandırılır.
Bakterilerin gram boyama karşısındaki reaksiyonun nedeni hücre çeperinin yapısı(murain
ağı) ile ilgilidir.
· Stoplazma zarı: Hücre duvarının hemen altında bulunan bu zar stoplazmayı
sarar ve korur. Hücre duvarına göre daha incedir. Bu zarın herhangi bir zarar
görmesi bakterinin ölümüne yol açar.
· Stoplazma: Fiziksel olarak berrak, hafif yapışkan bir sıvıdır. Fonksiyon
bakımından hücrede meydana gelen kimyasal reaksiyonların oluştuğu, hücrenin
yapımaddelerini sentezlendiği yerdir.
· Çekirdek: Bakteri hücresinin çekirdeği DNA (deoksiribonükleikasit) ve az
miktarda RNA (ribonükleikasit) dan ibarettir. Stoplazma içinde bunların fazla
bulunduğu yerlere çekirdek bölgesi adıverilir. Çekirdek zarıve çekirdekçik
bakterilerde bulunmaz.
· Kamçı(flegella): bakterilere özgü ve hücrede hareketi sağlayan bir yapıdır.
Flegella tek veya daha fazla sayıda olabilir
· Kapsül: Hücresel fonksiyonlar için gerekli değildir. Ancak bulunduğu
bakteride depo besin maddelerinin biriktirilmesi ve metabolik atıkların
atımında rol oynar. Kapsül oluşturan bakterilerin gıdada gelişmesi sonucu
yapışkanlık (rop) oluşur. Ayrıca kapsül varlığıbakterilerin enfeksiyon
etkinliğini arttırmaktadır.
Bazıbakteriler hücre içinde, çevre koşullarına oldukça dayanıklıspor meydana
getirirler. Buna endospor denir Vejatatif hücre yaşamınıdevam ettirmek ve
bölünerek neslini sürdürmek için endospor oluşturmaya yönelir. Bakteriler besin yetersizliği,
çeşitli fiziksel ve kimyasal etmenler ve çevre koşullarındaki olumsuzluklar karşısında spor
oluşturur. Endospor oluşumu bir çoğalma şekli değildir, ancak neslin korunmasınısağlar.
Gıdalarda Bacillus ve Clostridium cinsleri endospor oluşturan önemli bakterileri cinsleridir.
BakterilerinMikroskopta Görünüşlerine (Morfoloji) Göre Sınıflandırılmaları
Mikroorganizmaların boyutlarımikron ile ifade edilir. Bir mikron mm?nin 1/1000?ni
ifade eder. Hücre içi organelleri çok daha küçüktür ve bunların boyutlarımilimikron=m?
veya nanometre=nm ile belirlenir. Bu ölçü birimi ise mikronun 1/1000?dir.
Bakteriler genellikle küresel veya uzun hücre şeklinde gözlenir. Küresel şekilli
hücreye sahip bakteriler genelde kok olarak isimlendirilir. Kokların hücre çapı0.5? veya
altına inerken, bazılarında 1.2??a kadar çıkabilmektedir
Buna göre kok şeklinde bir mikroorganizma hücresi bağımsız olarak bulunuyorsa ve
mikroskopta tek bir daire şeklinde görünüyorsa monokok, ikişer ikişer bir arada bulunuyorsa
diplokok, dört hücre bir arada ise tetrakok adınıalır.
Ayrıca zincir şeklinde, ikiden fazla hücre birbirine bağlıolarak dizilmişse streptekok,
küp veya balya şeklinde üç boyutta düzgün paket şeklinde hücre topluluklarıoluşturuyorsa
sarsina, yine üç boyutlu, fakat üzüm salkımışeklinde hücre topluluklarıoluşmuşsa bunlar da
stafilakok olarak isimlendirilir
Bakterilerde uzun hücre şekli çubuk olarak belirlenir. Bakteri cins ve türüne bağlı
olarak kısa, uzun, ince ve kalın çomaklar şeklinde farklılıklar gösterir. Çomak hücrelerinin
kalınlığı0.4 -1.0 ?, boylarıise 1.5 ? 5 ? arasında değişirse de, bazıtürlerde 30 ? 40 ? hatta
100 ??a kadar varan hücrelere de rastlanabilir Çubuklar bakteri cins ve türüne göre düzgün, hafif kıvrık, T , V, veya Y şeklinde hatta
mantar hifinde olduğu gibi ipliksi görünümde olabilir.
Çubuk şeklinde bakterilerin boylarıenlerine yakın olan bakterilere kokobasil, çift
çubuktan oluşan ikili oluşumlara diplobasil, birbirine değecek şekilde zincir oluşturunlar da
streptobasil olarak tanımlanır.
Spiral (sarmal) şeklindeki bakterilerin virgül şeklinde tek kıvrımlıolanlarına vibriyo,
birden çok kıvrımlıolanlara spirillum, yumuşak bükülebilenlere de spiroket adıverilir
Mikroorganizmalarda çubuk şekli için kullanılan tanımlar daha azdır.
Bakterilerin İsimlendirilmeleri
Bakterilerin isimlendirilmesinde her organizma iki isimle tanımlanır. Cins ismi büyük
harfle yazılır, tür ismi küçük harfle yazılır. Örneğin. Escherichia coli kısaltılarak da
yazılabilir. Örneğin E.coli.
Bakterilerin Genel Özellikleri
Prokaryotik özellik gösteren tek protista grubunda ( monera) yer alan bakteriler,
doğada su, hava, toprak, bitki, hayvan, insan vb. her yerde bulunabilmektedir.
Bakteriler tek hücreli canlıların büyük kısmınıoluştururlar. Genellikle çok hızlıüreme
gösterirler. Besinsel gereksinimleri basittir. Çevresel etmenlere uyum yetenekleri yüksektir.
Tipik çoğalma ikiye bölünme şeklindedir.
Bakteriler morfolojik (mikroskopta görünüşü) olarak kok, çubuk ve spiral şeklinde
görülür.
Bakterilerin Gelişimine Etki Eden Faktörler
Bir ortamda bakterilerin bulunmasıveya faaliyet göstermesini çevre koşullarıetkiler.
Bakterilerin gelişimine; hava (O2), sıcaklık, ortamın asitliği (pH), nem ve ozmotik basınç
etki eder.
· Oksijen
Mikroorganizmaların çoğalmalarıiçin en önemli gaz oksijendir. Oksijene olan
ihtiyaçlarına göre bakteriler dört grupta incelenir .
· Aeroplar: Bu bakteriler çoğalmalarıiçin oksijenli ortamda bulunmaları
zorunludur.
· Anaerop: Bu bakteriler oksijenli ortamda çoğalamaz. Bunlara mutlak
anaerop bakteriler de denir.
· Fakültatif anaerop: Oksijenli ve oksijensiz ortamda çoğalma ve
metabolik etkilerini sürdürme yeteneğindedir.
· Mikroaerofil: Çok az miktardaki oksijen yoğunluğunda üreyen
bakterilerdir.
Asetik asit bakterileri aeroplara, Clostridium cinsi türleri anaeroplara ve laktik sait
bakterileri de fakültatif anaeroplara örnektir.
Aerop Anaerop Fakültatif A. Mikroaerofil
· Sıcaklık
Bakteriler sıcaklık isteklerine göre üç grupta toplanır.
· Psikrofil (soğuk seven) bakteriler: Üreme ısılarıen düşük 0ºC, en
uygun sıcaklık ise 15-20ºC arasındadır.Soğukta saklanan besinlerin
bozulmasında önemli olan bakterilerdir.
· Mezofil (ılık seven) bakteriler: En düşük üreme ısıları5-15ºC, en uygun
sıcaklık ise 20-40ºC arasındadır. Özellikle insan ve sıcak kanlı
hayvanlarda hastalık yapan bakteriler bu gruba dahildir.
· Termofil (sıcak seven) bakteriler: En düşük üreme ısıları15-25ºC, en
iyi faaliyet sıcaklıkları45-55ºC arasında olmakla birlikte 60-70ºC? de
faaliyet gösterenler de bulunur. Konserve ve pastörize besinlerin
bozulmasında etkin rolleri vardır.
Asetik asit bakterilerinin tamamıile laktik asit bakterilerinin bir bölümü mezofil,
laktik asit bakterilerinin diğer bölümü ise termofil bakterilere dahildir.
Bakteriler Sıcaklık (º C )
Minimum Optimum
Psikrofil 0 º C 15 ? 20 º C
Mezofilik 5 ? 15 º C 20 ? 40 º C
Termofilik 15 ? 25 º C 45 ? 55 º C
· pH ve asitlik
pH simgesi ortamın asit veya baz durumunu belirler.
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
Asit özellik ??? Nötr ??? Baz özellik
Bakteriler özellikle insan ve hayvanda hastalık yapanlar, en çok pH= 6 – 8 arasında
ürer. Genel olarak pH= 4 – 9 sınırlarıarasında da iyi ürer.
· Asitli besinler : pH = 3.7 – 4.5 arası(domates ve meyveler)
· Orta asitli besinler : pH = 4.5 – 5.3 arası(etli sebzeler, makarna ve
çorbalar)
· Düşük asitli besinler : pH = 5.3 ? 7.0 arası(ıspanak, bezelye, fasulye, süt
ve su)
· Yüksek asitli besinler: pH = 3.0 – 3.7 arası(limon, sirke, bazımeyve
suları, turşu)
· Nem (Su)
Tüm canlıların yaşamlarınısürdürebilmeleri için su gereklidir. Hem hücreye besin
maddesinin taşınmasında hem de hücrede oluşan artık maddelerin atılmasında suyun önemi
büyüktür. Ayrıca hücrelerin normal biçim ve şekillerini korur.
Su, tüm besinlerde değişik oranlarda bulunur. En yüksek oranda taze sebze ve
meyvelerde % 75 – 95, sütte % 85, taze yumurtada % 70 – 75, ette % 45 ? 65 oranında
bulunur. Buna karşın tahıllar, kuru baklagiller, kuru yemişlerde ise % 5 – 15 arasında değişir.
Bakteriler çoğunlukla % 60 hatta % 90 su içeren ortamlarda ürer. Su oranıyüksek,
pH?sıuygun, besin ögelerinden zengin olan et, süt ve yumurtada çok hızlıürer.
· Ozmatik basınç
Mikroorganizmaların gelişmelerinde önemli çevre koşullarından biride
mikroorganizmanın bulunduğu ortamın ozmatik basıncıdır. Yani mikroorganizmaların
geliştiği ortamın tuz, şeker vb maddelerin konsantrasyonu gelişme için büyük önem taşır.
Halofilik ( tuz seven ) ve osmofilik ( şeker seven ) bakterilerin ortamdaki yoğunluğa bağlı
olarak gelişmeleri etkilenir.
Bakterilerin bir çoğu %10 elektrolit konsantrasyonuna dayanma yeteneğine sahiptir.
Fakat gelişip faaliyet gösterebilmeleri için en uygun ortam hücre içi ve dışısıvıda çözünmüş
iyon ve molekül konsantrasyonlarının aynıdeğerde olmasıdır. Eğer bu durum hücre dışı
sıvısının lehine bozulacak olursa, hücre su kaybına uğrar, yaşamıtehlikeye girer . Buna
plazmoliz denir. Tersine hücre içi sıvılehine ozmatik basınç artışıolduğunda, dışardan
hücre içine aşırısu girişi olur ve yaşam tehlikeye girer. Buna da turgor denir.
Bakterilerin Çoğalmaları
Canlıların soylarınısürdürmek amacıyla kendilerine benzer yapıve özelliklerde yeni
canlılar oluşturmalarına üreme veya çoğalma denir.
Bakteriler de diğer mikroorganizmalarda olduğu gibi eşeyli ve eşeysiz çoğalabilen
canlılardır.
Bakterilerde üreme mevcut bakteri sayısının katları;
1- ?2- ?4- ?8- ?16- ?32- ??? şeklinde olur. Bakteri cinsine göre
her bölünme arasındaki süre 20 dakika olabileceği gibi 24 saat veya daha uzun olabilir.
Bakterilerin çoğalmalarıdönem dönem incelenirse aşağıdaki grafik elde edilir
Bakteriler çoğunlukla ikiye bölünerek ürer. Önce bakteri hücresinin boyu uzar ve
hücre zarıortadan içeri doğru daralarak iki eşit yarıya bölünür. Bölünen hücreler birbirinden
ayrılarak iki yeni karakteri ortaya çıkarır .una eşeysiz üreme şekli denir.
Eşeyli üreme şeklinde ise aynıtürden fakat farklıözellikteki bakterilerin bir süre
birleşmeleri sonucu her ikisinin ortak özelliklerini taşıyan yeni hücreler oluşur.
Bakteri Sayısı
5 10 15 20 25 30 35 Süre
· a-b =gizli dönem
· b-c =logaritmik çoğalma
· c-d =durma dönemi
· d-e =ölüm dönemi
· a-b = Gizli dönem ( uyum dönemi) : Bakteriler çoğalacaklarıuygun ortama
ekilirse, önce gizli bir döneme girerek bulunduklarıortama alışmaya çalışır.
Yoğun metabolik aktivite söz konusudur. Bakterilerin gelişmesi için ön hazırlık
dönemidir.
· b-c = Logaritmik dönem : Bu dönemde hücreler hızlıbölünme durumuna girer
ve yüksek sayıda mikroorganizma meydana gelir.
· c-d = Durma dönemi : Ortamdaki besin maddelerinin azalması, metabolik
artıklar ve pH?ın elverişsiz hale gelmesi nedeniyle mikroorganizmaların
üremeleri yavaşlar.Çoğalmalarında durma görülür.
· d-e = Ölüm dönemi : Ortamda hem besin kalmamasıhem de artık maddelerin
zehirli etkisiyle bakteriler ölür.
Dolayısıyla mikroorganizmaların çoğalmalarına besin ögelerine olan ihtiyaçlarıve
çevreyle ilgili etkenler etki eder.
GıdaMikrobiyolojisinde Önemli BakteriGruplarıveÖzellikleri
Besinleri Kullanma Durumuna Göre Önemli Bakterilerin Gruplandırılması
· Laktik asit üreten bakteriler
En önemli grubu laktobacillus türleri oluşturur. Bunlar şekerleri kullanarak laktik asit
üretir. Bunun yanında yine şekerden az miktarlarda uçucu maddelerden asetik asit ve
karbondioksit, bazılarıise asetik asit, alkol, karbondioksit ve laktik asit üretir.Bunlar mezofil
bakterilerdir. Başlıcaları; Streptecoc, Leuconostoc, Pediococ, Lactobacillus cinsleridir.
· Diğer asit üreten bakteriler
Asetobacter ve Asetomonas cinsleri etil alkolü kullanarak asetik asit yapar.
Clostridium cinsleri spor oluşturur ve oksijensiz ortamda karbonhidratlardan bütirik asit
yaparlar.
· Lipolitik bakteriler
Yağların parçalanmasınısağlayan lipaz enzimini yapar. Bunlar; Pseudomonas,
Alcaligenes, Serratia, Mikrococcus cinsleridir.
· Proteolitik bakteriler
Bunlar proteinaz denen proteinleri parçalayıcıenzimleri oluşturarak proteinli besinleri
kullanırlar ve onların bozulmasına neden olur. Bazılarıasit de üretir. Bazılarıise oksijensiz
ortamda yalnızca proteinleri parçalayarak kötü kokulu hidrojen sülfit, amin, yağasitleri gibi
kimyasal maddeler oluşturur. Bacillus, Pseudomanas, Clostridium, Proteus cinsleri bu gruba
girer.
· Sakkarolitik bakteriler
Bunlar disakkaritleri ve nişastayı, amilaz enzimi ile şekerlere parçalar. Clostridium ve
Bacillus cinsleri bunlar arasındadır.
· Pektinolitik bakteriler
Pektin bir karbonhidrat çeşididir. Pektinaz enzimi Erwinia, Bacillus ve Clostridium
cinsleri ile mayalar tarafından yapılır. Pektini parçalar ve sebze meyvelerin yumuşamasına
neden olur.
· Termofilik bakteriler
En düşük 45ºC, en iyi 55 ºC ve üstünde üreyen bakterilerdir. Besinlerin bu ısı
derecesinde tutulmasıhalinde bozulmasına neden olur. Bacillus cinsleri ve Clostridium
thermosaccharolyticum konserve besinleri, Lactobacillus thermophlus ise sütü bozar.
· Sakrofilik bakteriler
Buzdolabı ısısında ürerler. Başlıcaları; Psödomonas, Achromobacter,
Flavobacterium?dur. Buzdolabında ve serin yerde uzun süre bekleyen besinleri bozar.
· Halofilik bakteriler
Gelişmeleri için bulunduklarıortamda tuza ihtiyaç duyan bakterilerdir. Tuz
gereksinimi % 2-30 arasında değişen bakteri türleri vardır. Bu bakteriler yüksek tuz içeren
gıdalarla salamura gıdalarda önem taşır. Başlıcaları; Sarsinia, Mikrococ, Psöudomanas,
Acromabacter?dir.
· Osmofilik bakteriler
Yüksek şeker yoğunluğunda üreyen bakterilerdir. Leuconostoc gibi orta şeker
yoğunluğunda üreyebilen bakteriler bu grupta yer alır.
Genel Özelliklerine Göre Gruplandırma
· Gram negatif, aerop çubuklar ve koklar
· Pseudomonas cinsi; bazıtürleri proteolitik ve lipolitik aktivite gösterir.
Aerobik olmalarınedeniyle gıdaların yüzeyinde hızla gelişerek mukoz
madde oluştururlar. Psikrofil, mezofil türleri vardır. Özellikle soğukta
saklanan et, tavuk eti, yumurta ve deniz ürünlerinin bozulma etmenidir.
Pseudomanas türleri toprak, su ve bitkilerde yaygın olarak bulunur.
P.aureginosa gastoenterik hastalıklara neden olabilir. Bazıgıda maddeleri
üzerinde yeşilimtrak, siyah, kahverengi pigment oluştururlar.
· Halococcus cinsi; H. morrhuae bu cinsin tek türüdür. Turuncu ve
kırmızıpigment oluştururlar ve tuzlanmışet, balık ve et ürünlerinde
gelişerek bozulmaya neden olur.
· Alcaligenes cinsi; Pigment oluşturmaz. Toprak, su, toz, çiğsüt, kanatlı
etleri ve dışkıda yaygın olarak bulunur. Et, yumurta ve süt gibi proteince
zengin ürünlerin bozulmasına neden olur.
· Gram negatif, fakültatif anaerop çubuklar
· Escherichia cinsi: Mikroorganizma doğal olarak insanların ve
hayvanların bağırsak florasında bulunur. Ancak bağırsak dışında da
yaşamınıuzun süre devam ettirir. Bu nedenle toprakta ve suda yaygın
olarak bulunur. Bu nedenle de gıdalarda ve sularda E.coli bulunması
fekal (dışkı) bulaşmanın bir göstergesi olarak kullanılır.
· Salmonella cinsi: İnsanlarda patojen etkilidir ve öldürücü hastalıklara
neden olur. En önemlisi tifodur. Salmonella doğal olarak insan ve hayvan
bağırsağında ve kanalizasyon sularında bulunur. Hastalık etmeni
endotoksin (iç zehir) lerdir. Zehirlenme kontamine (bulaşma) olmuşet,
süt, yumurta ve balık gibi hayvansal gıdalar olmak üzere, bitkisel ürünler
ve su ile olur. Bu cinse ait hiçbir bakterinin gıda maddesi üzerinde
bulunmasına izin verilmez. En fazla sorun soğuk tüketilen yiyecekler, çiğ
sütten işlenen ürünler ve kanatlıetleri ile yaşanmaktadır.
· Shigella cinsi: Sıcakkanlıların bağırsak sisteminde yaşayan türleri içerir.
Shigella kirli sularda bulunur. Kirli sularla veya insanlardan gıda
maddesine bulaşır. Gıdalarda bulunmasına kesinlikle izin verilmez.
· Enterobacter cinsi: Toprak, su, kanalizasyon suları, bitkilerde ve insan
bağırsağında yaygın olarak bulunur. Metabolizma ürünleri kötü koku ve
salyamsıyapıoluşturur.
· Erwinia cinsi: Başta früktoz olmak üzere bazıkarbonhidratlardan asit
oluşturma yeteneğindedir. Bitkisel ürünlerde depolama sırasında sulanma
ve sünmeye yol açar. Depolanan bitkisel ürünlerde çürüme yapar.
· Proteus cinsi; toprak, su, bitki, çürümüşorganik artıklar, insan ve
hayvan bağırsağında bulunur. Et, yumurta, balık ve diğer gıdalarda
kokuşma etkenidir. Protein kaynaklıgıdalarda bozulma etmenidir. Gıda
kaynaklıenfeksiyona neden olabilir.
· Gram pozitif koklar
· Mikrococus cinsi: Türleri doğal olarak insan ve hayvan derisinde ve deri
salgılarında, bunun dışında toprak, su, et ve süt ürünlerinde bulunur.
Saprofit (çürükçül) olarak faaliyet gösterir. Patojen (hastalık yapan)
etkileri yoktur. Besinlerden peynirlerin olgunlaştırılmasına, pastörize
sütlerin bozulmasına, fermente et ürünlerinde (sucuk) nitratınitrite
indirger. Mikroorganizmaların bazıtürleri pembe ve kırmızıpigment
oluşturur.
· Staphylcoccus cinsi: Patojen türler içeren ve gıda rahatsızlıklarına neden
olan bu cinsin S.aureus, gıda teknolojisinde önemlidir. Staphylcoccus
cinsleri deride, sıcakkanlıcanlıların burun boşluğu ve salgısında bulunur.
Sığırlarda mastitise neden olur. Toksin sıcaklık uygulamalarına
dayanıklılık gösterir. Gıdalarda en fazla süt ve süt ürünlerinde ve deniz
ürünlerinde tehlikelidir.
· Streptecoccus cinsi: Genellikle insan ve hayvanlar için patojendir. Gıda
teknolojisinde yararlıyönü ile yoğurt üretiminde starter olarak kullanılan
S.thermophilus?tur. Hafif proteolitik yeteneği nedeni ile hem peynirlerin
olgunlaşmasına hem de yoğurtta L.bulgaricus?un gelişmesine yardımcı
olur.
· Lactococcus cinsi: Süt ve süt ürünlerinde bulunur, laktozu fermente eder,
patojen değildir, sütü kısa sürede pıhtılaştırır. Süt endüstrisinde starter
olarak kullanılır, peynirlerin olgunlaşmasında rol oynar.
· Enterococcus cinsi: Enterococcus grubu streptecoclar genelde insan ve
hayvan bağırsaklarında yaşar, sıcaklığa dayanıklı olmaları ile
streptecoclardan ayrılır. Gıdalardan daha fazla süt ve süt ürünlerinde
görülür. Fekal bulaşmanın ayıracıdır. İçme sularında fekal bulaşma
belirtecidir. Enterococlar çürüme etmeni olarak et ürünleri, kanatlıetleri,
sebze ve diğer gıdaların bozulma nedenidir. Fermente süt ürünlerinde
olgunlaşma yönünden yararlımikroorganizmalardır.
· Leuconostoc cinsi: Özellikle şeker endüstrisinde ve alkolsüz meşrubat
üretiminde istenmeyen mikroorganizmalardır. Leuconostoc türleri kısmen
de olsa tereyağıve peynir üretiminde asit ve aroma oluşumu için starter
olarak kullanılır. Bunun yanında süt ve süt ürünlerinde zararlısaprofit
olarak bulunur.
· Endospor oluşturan, gram pozitif çubuklar ve koklar
· Bacillus cinsi: Psikrofil, mezofil ve termofil olan türler vardır. Gıdaların
pastörizasyonunda önemlidir. Aerob gelişirler, şekerleri fermente ederler,
gaz oluşumu izlenmeden asit ortaya çıkar. Doğada toprak ve bitkilerde
çok yaygındır. Bacillus cinsi içinde yer alan türlerden pek azıpatojendir.
B.cereus endotoksin (iç zehir)ler ile gıda rahatsızlıklarıetmenidir. Taze
sebze ve meyvelerde çürüme ve ekşimeye, konserve veya hazır gıdalarda
ekşime ve kokuşmaya neden olurlar. Bacillus cinsi bakteriler gıda
teknolojisinde yararlıolarak da bilinir. Bu cinse ait bazıtürler amilaz ve
proteaz üretiminde kullanılır.
· Clostridium cinsi: Gıda teknolojisinde en önemli bakteri türlerinden bir
bölümü bu cins içinde yer alır. Bunlardan C.botulinum, C.perfringens, en
yaygın görülenlerdir. C.botulinum endotoksin oluşturan tehlikeli insan
patojenidir. Yetersiz ısıl işlem uygulanmışkonserve gıdaların en önemli
bozulma nedenidir ve bombaj oluşturmak suretiyle kendini belli eder.
C.perfringens toksin oluşumunu gıda maddesi yerine bağırsakta sağlar ve
bu nedenle enterotoksindir.
· Sporsuz, gram pozitif düzgün çubuklar
· Lactobacillus cinsi: Doğada en yaygın bakterilerdendir. Bitkiler,
meyveler, insan ve hayvanların ağız ve bağırsaklarında bulunur. Yoğurt,
peynir gibi süt ürünlerini, turşu veya salamura meyve sebzelerin
hazırlanmasında veya olgunlaşmasında önemli rol oynar.
Karbonhidratlarılaktik aside fermente eder. Ancak birçok bitkisel ve
hayvansal ürünlerde (içme sütü, meyve ve meyve suları, hazır
yemekler,bira, şarap vb) ekşimeye neden olduklarıiçin bozulma
etmenidir. Lactobacillus cinsine ait türler gelişme sıcaklıklarıve
metabolizma ürünleri dikkate alınarak kendi aralarında alt cinslere ayrılır.
Bunların en önemlisi L.bulgaricus süt ve yoğurtta bulunur.
S.thermophilus ile birlikte yoğurt üretiminde starter alarak kullanılır.
L.lactis süt ve peynirlerde bulunur. Sütü ekşitir ve koagüle eder.
? Listeria cinsi: Toprakda, bitkilerde, kanalizasyon sularında, hayvan
yemlerinde, gübrede ve taşıyıcıinsan ve hayvanlarda bulunur.
· Sporsuz, gram pozitif düzgün olmayan çubuklar
· Corynebacterium cinsi: Patojen türleri içerir, toprak, su, hava,
bitkilerde, insan ve hayvanların bağırsak sistemlerinde ve deride bulunur.
Halk arasında kuşpalazıolarak da bilinen difteri hastalığının etmeni
C.diphtheriaedır. Bulaşmasıgenellikle gıdalar ile olur.
Lam, Lamel, Mikroskop Kullanımıve Bakımı
Mikroskop; mikroorganizmaların görülebilmeleri için büyütülmelerini ve görülebilir
hale getirilmelerini sağlayan mikrobiyolojinin önemli aracıdır
Mikrobiyoloji laboratuvarında genellikle aydınlık alanlı mikroskoplar
kullanılmaktadır.Bunun dışında kullanılan mikroskoplar karanlık alanlı, ultraviole,
fluoresans, faz-kontrast, elektron mikroskoblarıdır.
Mikroskopta optik ve mekanik olmak üzere iki kısım vardır;
· Mekanik Kısım
· Ana tüp: Optik kısma ve aydınlatma sistemine destek görevi görür. Üst
tarafta 160-180 mm uzunluğunda optik kısımlarıtaşıyan ve bazı
mikroskoplarda ana tüpün içinde ayarlanabilen çekme tüp bulunmaktadır.
· Tabla: Ana tüpün alt tarafında, üzerine preparatın konduğu kısımdır.
· Kıskaç: Tabla üzerinde lamısabitleştirmek için kullanılır.
· Kol: Ana tüple tabla kol yardımıile birleşir. Mikroskobun kaldırılması
veya taşınmasına yardımcıolur.
· Ayak: Tablanın alt tarafında at nalışeklindeki ayak mikroskobun
istenilen pozisyonda durmasınısağlar. Kol ve ayak eğilme yeri (eklem)
adıverilen mekanizmayla bağlıdır.
Tüpün üst kısmında oküler, alt ucunda objektiflerin vidalandığırevolver bulunur.
Kolun her iki yanında kaba ayar (makro), ince ayar (mikro) vidalarıyer alır.
Kaba ayar vidasıile objektif aşağıve yukarıhareket ettirerek obje yaklaşık olarak
bulunur.
İnce ayar vidasıile görüntü netleştirilir.
· Kondansör vidası: Kondansörü aşağıve yukarıhareket ettiren vidadır.
Hızlıvida da denmektedir.
· Optik Kısım: Aydınlatma sistemi (ayna, diyafram, iris) ve kondansörden
ibarettir.
· Ayna: Işınlarıpreparat üzerine yansıtmaya yarar.
· Kondansör: Aynadan gelen ışınlarıpreparat üzerinde toplayan mercekler
sistemidir.
· Diyafram: Kondansörün alt kısmında bulunur, objektife giren ışık
diyaframla kontrol edilir.
· Objektif: Aydınlanan cisimden gelen ışınlarıtüpe geçiren mercekler
sistemidir. Mikroskopta bulunan üç objektifin büyütme ölçüleri farklıdır.
En kısa objektif üzerinde 10x yazar ve en az büyütme gözlenir. Diğer
objektifte 40x yazar en fazla büyütür. En uzun objektifin üzerinde ise 90x
veya 100x yazar buna immersion objektifi denir. İmmersiyon
objektifindeki mercek çok küçüktür ki, yeteri kadar ışık mercekten içeri
geçemez. Bunu sağlamak üzere kırılma indisi cam ile aynıolan sedir
(immersiyon) yağıdamlatılarak kullanılmasıgerekir. İmmersiyon
objektifi kullanılacağızaman preparat üzerine bir damla sedir yağı
damlatılır ve objektif sedir yağına batırılarak inceleme yapılır.
· Oküler: Ana tüpün üst ucuna yerleştirilen mercekler sistemine oküler
denir. Mikroskopta her biri çeşitli (10x, 15x, 20x) büyütme gücüne sahip
üç adet yedek oküler bulunur.
Oküler büyütmesi 10x, objektifinki 100x, mikroskopta incelenen bir cisim 1000 defa
büyümüşolarak görülür.
Lam kalınlığı1mm, eni 25 mm ve boyu 75 mm kadar olan cam parçasıdır. Örnek
bunun üzerine ince bir tabaka yapacak şekilde yayılır. Mikroorganizmalarımikroskopta
inceleyebilmek amacıyla kullanılır.
Lamel ise 170? kalınlığında genellikle kare şeklinde ince cam levhadır. Kareler
18×18, 24×24 mm ebadında değişik ölçülerde lameller vardır. Lam üzerinde bulunan örneğin
üzerine arada hava kalmayacak şekilde yavaşça kapatılır. Mikroorganizmalarıincelenmesi
amacıyla kullanılır.
Mikroorganizmaların lam ve lamel aracılığıile mikroskopta incelenecek duruma
getirilmesine preparat hazırlama denir. Bir damla örnek lam üzerine konup, lamelle
kapatılarak preparat hazırlanabileceği gibi, çeşitli boyama yöntemleriyle de hazırlanabilir.
Mikroskopta preparat hazırlayarak incelenecek herhangi bir maddeye örnek denir.
- Genel
- Yorumlar(0)